
Dr Jan Frederik Gogarten
Présentation
Jan Gogarten est un écologiste spécialiste des maladies des animaux sauvages qui a récemment mis en place le projet de recherche « Evolutionäre Gemeinschaftsökologie », « Ecologie Evolutive des Communautés» à l'Institut Helmholtz pour One Health à Greifswald. Il a été élu à la Global Young Academy en 2023 et s'engage pour une plus grande diversité des perspectives dans le domaine scientifique. Au cours des dix dernières années, il a travaillé dans deux points chauds en biodiversité : en Ouganda et en Côte d'Ivoire. Jan Gogarten a publié de nombreux articles sur l'écologie, la biologie évolutive, la microbiologie et la virologie, ce qui souligne son engagement en faveur de la transdisciplinarité, nécessaire au développement du concept One Health. L'apparition de pathogènes dans les écosystèmes peut affecter dramatiquement l'humanité. Parallèlement, les maladies jouent un rôle crucial dans la régulation des populations d'animaux sauvages et leur conservation à long terme. Par ses recherches, Jan Gogarten vise à établir une politique de protection de la nature reposant sur une existence durable avec la biodiversité. D'une part, Jan Gogarten cherche à comprendre les processus qui influencent et maintiennent la diversité animale et microbienne dans les écosystèmes. D'autre part, il développe des stratégies visant à comprendre et à freiner l’émergence des maladies dans les populations humaines et sauvages. Pour ce faire, il a développé une méthode non-invasive pour analyser et déterminer l’ADN environnemental des hôtes et des pathogènes en milieu naturel.
Jan Gogarten s'intéresse à la santé en général et plus particulièrement aux facteurs qui influencent la composition des communautés d'hôtes dans les milieux naturels. Il se penche sur les communautés des micro-organismes de ces hôtes. Il associe ces types de données afin d'obtenir un aperçu sur l’émergence des maladies et du processus de transmission entre hôtes et espèces, tout en s’appuyant sur la phylogénétique. Il fait fréquemment des recherches sur les primates sauvages non humains et utilise des outils moléculaires variés, notamment le metabarcoding, l'ADN environnemental et la détection par hybridation.
Jan a suivi des études de biologie et d'anthropologie à l'Université McGill au Canada et a ensuite obtenu un master en anthropologie biologique à l'Université Stony Brook. Il a obtenu son doctorat en biologie à l'Université McGill en 2017 sous les directeurs doctoraux Dr Jonathan Davies et de Colin Chapman. Pendant sa thèse de doctorat, il a été rattaché au RKI et au MPI dans la section anthropologie évolutionnaire et a travaillé en étroite collaboration avec le Tai Chimpanzee Project et les Dr. Roman Wittig, Fabian Leendertz et Sébastien Calvignac-Spencer. Il a ensuite accepté un poste postdoctoral à l'Université de Columbia avec les Dr Thomas Briese et Ian Lipkin, suivi d'un séjour postdoctoral au RKI où il a fait des recherches dans le groupe « DFG, Sozialität und Gesundheit bei Primaten » (Socialité et santé chez les primates), lequel étudie l'interaction entre la socialité et la diversité microbienne en coopération avec Sébastien Calvignac-Spencer.
Liste complète des publications
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Jahan M, Lagostina L, Gräßle T, Couacy-Hymann E, Kouadio L, Kouakou VK, Krou HA, Mossoun A, Patrono LV, Pléh K, Steiner JA, Yves N, Leendertz FH, Calvignac-Spencer S*#, Gogarten JF*#. (2023) Fly iDNA suggests strict reliance of the causative agent of sylvatic anthrax on rainforest ecosystems. Environmental DNA.
Gogarten JF#. (2022) Roles for non-human primate-associated phage diversity in improving medicine and public health. Evolution, Medicine, and Public Health. 10: 123-129.
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Gogarten JF#, Rühlemann M, Archie E, Tung J, Akoua-Koffi C, Bang C, Deschner T, Muyembe-Tamfun J-J, Robbins MM, Schubert G, Surbeck M, Wittig RM, Zuberbühler K, Baines JF, Franke A, Leendertz FH, Calvignac-Spencer S#. (2021) Primate phageomes are structured by superhost phylogeny and environment. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118: e2013535118.
Gogarten JF*, Hoffmann C*, Arandjelovic M, Sachse A, Merkel K, Dieguez P, Boesch C, Agbor A, Angedakin S, Brazzola G, Corogenes K, Jones S, Langergraber KE, Lee K, Marrocoli S, Murai M, Sommer V, Zuberbuehler K, Kühl H, Leendertz FH, Calvignac-Spencer S#. (2020) Fly-derived DNA and camera traps are complementary tools for assessing mammalian biodiversity. Environmental DNA. 2: 63-76.
Gogarten JF, Düx A, Mubemba B, Pléh K, Hoffmann C, Mielke A, Müller-Tiburtius J, Sachse A, Wittig RM, Calvignac-Spencer S#, Leendertz FH#. (2019) Tropical rainforest flies carrying pathogens form stable associations with social non-human primates. Molecular Ecology. 28: 4242– 4258.
Gogarten JF, Davies TJ, Benjamino J, Gogarten JP, Graf J, Mielke A, Mundry R, Nelson MC, Wittig RM#, Leendertz FH*#, Calvignac-Spencer S*#. (2018) Factors influencing bacterial microbiome composition in a wild non-human primate community in Taï National Park, Côte d’Ivoire. The ISME Journal. 12: 2559-74.
Knauf S*, Gogarten JF*, Schuenemann VJ*, De Nys HM*, Düx A, Strouhal M, Mikalová L, Bos KI, Armstrong R, Batamuzi EK, Chuma IS, Davoust B, Diatta G, Fyumagwa RD, Kazwala RR, Keyyu JD, Lejora IAV, Levasseur A, Liu H, Mayhew MA, Mediannikov O, Raoult D, Wittig RM, Roos C, Leendertz FH, Šmajs D#, Nieselt K#, Krause J*, Calvignac-Spencer S*#. (2018) Nonhuman primates across sub-Saharan Africa are infected with the yaws bacterium Treponema pallidum subsp. pertenue. Emerging Microbes and Infections. 7: 157.
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Marí Saéz A*, Weiss S*, Nowak K*, Lapeyre V*, Zimmermann F, Düx A, Kühl HS, Kaba M, Regnaut S, Merkel K, Sachse A, Thiesen U, Villányi L, Boesch C, Dabrowski PW, Radonić A, Nitsche A, Leendertz SAJ, Petterson S, Becker S, Krähling V, Couacy-Hymann E, Akoua-Koffi C, Weber N, Schaade L, Fahr J, Borchert M, Gogarten JF*, Calvignac-Spencer S*, Leendertz FH#. (2015) Zoonotic origin of the West African Ebola epidemic. EMBO Molecular Medicine. 7: 17-23.